Kelelawar ditemukan membawa virus herpes baru

Dalam penelitian terbaru yang dipublikasikan di Laporan Ilmiah, tim peneliti dari Wuhan, Tiongkok, menemukan bahwa berbagai spesies kelelawar pemakan serangga di Tiongkok tengah merupakan inang atau reservoir alami Virus β- dan γ-herpes, dengan virus dari keluarga Herpesviridae menunjukkan batasan jangkauan inang dan analisis filogenetik menunjukkan adanya penularan silang antar spesies sebelumnya.

Penyakit zoonosis selalu menjadi ancaman serius terhadap kesehatan manusia dan perekonomian, mengingat sistem kekebalan tubuh manusia dan teknologi medis global seringkali tidak siap menghadapi virus yang ditularkan dari spesies hewan lain. Pandemi penyakit virus corona 2019 (COVID-19) adalah contoh utama bagaimana penyakit zoonosis berdampak pada kehidupan manusia dan perekonomian global.

Faktor-faktor seperti hidup dalam kelompok besar dan memiliki persebaran yang luas seringkali mengakibatkan kelelawar berperan sebagai reservoir berbagai patogen. Kesamaan genetik antara kelelawar dan mamalia lain seperti manusia dan ternak telah menyebabkan berjangkitnya berbagai virus zoonosis seperti virus corona sindrom pernapasan akut parah (SARS-CoV), virus Ebola, lyssavirus, dan henipavirus.

Virus dari keluarga Herpesviridae memiliki asam deoksiribonukleat (DNA) untai ganda linier dengan ukuran genom berkisar antara 124 hingga 295 kilobase pair (kbp). Virus ini telah ditemukan pada banyak hewan, termasuk kerang, ikan, amfibi, reptil, burung, dan mamalia. Virus herpes mamalia dibagi menjadi tiga subfamili: α-, β-, dan γ-herpesvirus, dan banyak spesies virus herpes manusia, seperti cytomegalovirus, virus Epstein-Barr, virus terkait sarkoma Kaposi, dan virus herpes manusia 6A, 6B, dan 7, diketahui mampu menyebabkan infeksi dengan morbiditas parah.

Dalam penelitian ini, para ilmuwan mengumpulkan berbagai spesies kelelawar pemakan serangga dari gua-gua di berbagai daerah sekitar kota Wuhan di Provinsi Hubei dan menggunakan teknik molekuler untuk menentukan keberadaan virus herpes pada kelelawar tersebut. Karakteristik epidemiologi virus herpes yang terdeteksi dipelajari menggunakan metode filogenetik.

Kelelawar awalnya diidentifikasi berdasarkan morfologi, dan gen sitokrom b kemudian diamplifikasi menggunakan reaksi berantai polimerase (PCR) dan diurutkan dari DNA yang diekstraksi dari kelelawar tersebut untuk memastikan identifikasi spesies. DNA genom yang diperoleh dari jaringan hati dan usus juga telah digunakan untuk melakukan amplifikasi PCR bersarang yang menargetkan gen dpol DNA polimerase pada virus herpes. Selain itu, gen glikoprotein B telah digunakan untuk mengkarakterisasi lebih lanjut virus herpes.

Alat Pencarian Keselarasan Lokal Dasar, atau BLAST, yang disediakan oleh Pusat Informasi Bioteknologi Nasional digunakan untuk mendapatkan rangkaian virus herpes yang dipublikasikan dan paling mirip dengan rangkaian virus herpes dalam penelitian ini. Urutan yang dipublikasikan dan yang diperoleh dalam penelitian ini kemudian digunakan untuk membangun pohon filogenetik untuk memahami hubungan antara virus herpes yang baru ditemukan dan yang diidentifikasi sebelumnya. Urutan sitokrom b yang dihasilkan untuk spesies kelelawar juga digunakan untuk membangun pohon filogenetik inang guna menentukan pola korelasi antara virus herpes dan inangnya.

Penelitian ini menemukan empat strain dari genus Betaherpesvirus dan 18 strain Gammaherpesvirus pada 22 dari 140 kelelawar yang dikumpulkan. Pada spesies kelelawar Rhinolophus pusillus atau kelelawar tapal kuda kecil, prevalensi virus herpes sebesar 26,3%, sedangkan pada spesies mikrobat Myotis davidii sebesar 8,4%. Strain γ-herpesvirus yang paling sering terdeteksi adalah strain RP701, yang juga memiliki kemiripan terbesar dengan γ-herpesvirus ruminansia. Salah satu strain Gammaherpesvirus lainnya, MD704, menunjukkan kemiripan terbesar dengan γ-herpesvirus landak.

Sebaran M. Davidii terbentang dari wilayah tengah hingga utara Tiongkok, sedangkan R. Pusillus ditemukan di wilayah Indo-Melayu. Penelitian lain juga telah mengidentifikasi strain virus herpes RP701 pada kelelawar yang ditemukan di Tiongkok selatan, yang menunjukkan bahwa RP701 tersebar luas dan memiliki nenek moyang yang sama dengan virus herpes yang ditemukan pada hewan ruminansia.

Selain itu, empat virus β-herpes telah diidentifikasi pada M. Davidii dan menunjukkan kemiripan 79% hingga 83% dengan virus β-herpes yang diketahui. Virus β-herpes ini juga termasuk dalam klade yang sama dengan virus β-herpes yang diidentifikasi pada kelelawar lain dari famili Vespertilionidae, yang termasuk dalam M. Davidii. Hasil ini menunjukkan bahwa virus β-herpes baru mungkin memiliki inang selain M. Davidii, dan bahwa kontak dekat antara individu dari spesies berbeda dari famili Vespertilionidae dalam koloni dapat memfasilitasi penularan virus β-herpes ini antarspesies.

Untuk meringkas, penelitian ini mengidentifikasi empat strain baru β-herpesvirus dan 18 strain baru γ-herpesvirus pada 22 kelelawar yang dikumpulkan dari daerah sekitar kota Wuhan. Dua strain yang umum memiliki kesamaan dengan virus herpes yang ditemukan pada hewan ruminansia dan landak, sehingga menunjukkan potensi penularan ke mamalia lain dan kemungkinan berjangkitnya penyakit zoonosis.

Hasil ini menyoroti perlunya pengawasan berkelanjutan terhadap populasi kelelawar dalam jumlah besar dan pemantauan reservoir virus di inang tersebut untuk memastikan kesiapsiagaan terhadap potensi wabah penyakit zoonosis.