Inklusi RNA Inang Terkait dengan Infeksi Hepatitis E Kronis

Jika virus memasukkan segmen genom inang ke dalam susunan genetiknya, infeksinya bisa menjadi kronis.

• Mengapa hepatitis E menjadi kronis pada beberapa pasien, dan mengapa obat-obatan tidak bekerja?

Untuk mengetahuinya, tim peneliti internasional yang dipimpin oleh ilmuwan dari Bochum mengamati seorang pasien dengan infeksi hepatitis E kronis selama setahun. Pengurutan ulang RNA virus menunjukkan bahwa virus telah memasukkan berbagai bagian mRNA inang ke dalam genomnya. Hal ini menghasilkan keuntungan replikasi yang dapat berkontribusi pada kronisitas infeksi.

• Pengaktifan RNA inang dapat memprediksi transisi dari infeksi akut ke infeksi kronis

Dr. Daniel Todt, Kepala Kelompok Penelitian Virologi Komputasi, Departemen Virologi Medis dan Molekuler, Universitas Ruhr Bochum, Jerman

Para peneliti melaporkan hal ini di jurnal Nature Communications.

• Mengurutkan populasi virus

Sekitar 20 juta orang di seluruh dunia terinfeksi hepatitis E setiap tahunnya. Infeksi ini biasanya hilang tanpa konsekuensi, namun dapat mengancam nyawa wanita hamil atau orang dengan sistem kekebalan tubuh yang lemah. Dalam beberapa kasus, penyakit ini menjadi kronis. Tidak ada obat spesifik yang efektif. Obat antivirus ribavirin spektrum luas juga digunakan untuk melawan hepatitis E, namun tidak selalu berhasil.

• Bagaimana virus bisa lolos dari sistem kekebalan tubuh? Mengapa infeksinya menjadi kronis dan tidak kunjung sembuh?

Para peneliti untuk pertama kalinya menganalisis seluruh populasi virus pada pasien yang terinfeksi kronis selama lebih dari setahun. Mereka mempelajari lebih dari 180 urutan individu dari sampel darah secara mendetail.

• Replikasi dalam kultur sel menggunakan RNA inang

"Virus hepatitis E memiliki apa yang disebut wilayah hipervariabel dalam informasi genetiknya, di mana ia dapat menggabungkan rangkaian RNA berbeda dari sel inang," jelas Daniel Todt. Timnya mampu menunjukkan bahwa komposisi wilayah ini berubah secara signifikan selama periode pengamatan. Selain itu, banyak komposisi berbeda muncul secara bersamaan. Dalam percobaan kultur sel, terlihat bahwa penggabungan RNA inang memberikan keuntungan replikasi: virus yang dimodifikasi mampu bereplikasi lebih baik daripada virus lain. “Kami menduga hal ini ikut bertanggung jawab atas kronisitas infeksi dan kegagalan terapi,” kata Daniel Todt.

• Studi tentang RNA inang yang dimasukkan ke dalam virus

Para peneliti menganalisis komposisi RNA inang yang dimasukkan ke dalam virus untuk menentukan apakah terdapat ciri-ciri umum yang menjadi ciri segmen genetik. “Namun, kami tidak menemukan kesamaan yang signifikan,” kata Todt. Urutan gen yang disertakan sebagian besar merupakan urutan yang sangat umum di sel inang, yang menunjukkan seleksi acak.

• "Ada kemungkinan pada saat infeksi hepatitis E, terjadi perlombaan antara virus dan sistem kekebalan tubuh," saran Daniel Todt.

Jika virus berhasil memasukkan RNA inang sebelum sistem kekebalan berhasil melawan infeksi, hal ini dapat menyebabkan penyakit kronis. "RNA inang dalam genom virus, bagaimanapun juga, dapat berfungsi sebagai penanda biologis pada fase akut infeksi, yang menunjukkan kemungkinan awal terjadinya infeksi kronis."

• Merencanakan studi lebih lanjut

Para peneliti berencana untuk memperluas studi mereka ke kelompok pasien yang lebih besar.