Analisis mengungkap bukti baru lonjakan global dalam infeksi streptokokus grup A

Streptococcus Grup A (Strep A) adalah jenis bakteri umum yang umumnya menyebabkan infeksi tenggorokan dan demam berdarah gaya>. Meskipun sebagian besar infeksinya ringan, dalam kasus yang jarang terjadi, Strep A dapat menyebabkan infeksi invasif yang dapat berakibat fatal.

Antara tahun 2022 dan 2023, layanan kesehatan di seluruh dunia mencatat lonjakan infeksi Strep A invasif yang parah setelah pembatasan pandemi dicabut. Sebuah studi baru yang dilakukan oleh para ilmuwan dari Imperial College London dan Badan Kesehatan Masyarakat Inggris mengonfirmasi bahwa varian bakteri yang disebut M1UK memainkan peran penting dalam peningkatan ini.

Strain M1 diketahui menyebabkan infeksi yang lebih invasif dibandingkan jenis Strep A lainnya. Meskipun varian ini pertama kali diidentifikasi dan diurutkan di Inggris, M1UK baru-baru ini dikaitkan dengan peningkatan infeksi parah di Eropa, Australia, Amerika Utara dan Jepang setelah mencabut pembatasan pandemi. Ia juga ditemukan di Amerika Selatan, Selandia Baru, dan Taiwan.

Rendahnya tingkat infeksi Strep A selama pandemi ini kemungkinan besar membuat masyarakat, terutama anak-anak, sangat rentan terhadap infeksi ini, sehingga berkontribusi terhadap lonjakan kasus di banyak negara.

Dalam studi baru tentang genetika M1UK, yang diterbitkan di Nature Communications, para ilmuwan memberikan data baru tentang kapan varian tersebut pertama kali muncul dan bagaimana perbandingannya dengan strain lain.

Distribusi global dan potensi masuknya M1UK dan populasi perantara. Pohon filogenetik dari 2364 M1UK dan strain perantara dikumpulkan di seluruh dunia dari Maret 2005 hingga Juli 2023. B Pohon penularan yang disederhanakan dihasilkan dengan PastML yang menunjukkan lokasi asal usul epidemi leluhur dari garis keturunan M1UK dan populasi perantara. C Estimasi ukuran populasi efektif (Ne) M1UK di Inggris dari waktu ke waktu. Komunikasi Alam (2024). DOI: 10.1038/s41467-024-47929-7

Dengan menggunakan pengurutan genetik sampel pasien yang dikombinasikan dengan pemodelan komputer, mereka menemukan bahwa M1UK kemungkinan besar muncul sekitar tahun 2008 dan mulai meningkat secara bertahap mulai tahun 2010.

Dibandingkan dengan strain M1 sebelumnya, yang relatif tidak berubah selama 40 tahun terakhir, M1UK menghasilkan lebih banyak racun yang menyebabkan demam berdarah.

Profesor Shiranee Sriskandan, dari Departemen Penyakit Menular di Imperial College London, yang memimpin penelitian bersama rekan-rekan UKHSA, mengatakan: “Bakteri berevolusi seiring waktu, dan karena Strep A secara eksklusif merupakan patogen manusia, bakteri tersebut mengalami perubahan genetik seiring dengan perkembangannya. Menyebar melalui populasi. Sebagian besar varian datang dan pergi seiring berjalannya waktu, namun M1UK tampaknya kini telah mengakar di Inggris dan negara lain. Apakah hal ini akan tetap demikian dalam jangka panjang masih belum diketahui.”

Sejarah genetik

Dengan menggunakan penelusuran database genom global, tim menunjukkan bahwa ketika M1UK pertama kali ditemukan di Inggris pada tahun 2019, hanya dua strain M1UK yang dapat diidentifikasi dari rangkaian genom di luar Inggris. Namun analisis selanjutnya dari negara lain yang meneliti tren perubahan infeksi Strep A (termasuk infeksi invasif) menunjukkan bahwa M1UK kini terdapat di lebih dari 10 negara di seluruh dunia dan dalam beberapa kasus telah menjadi jenis yang dominan pada periode pascapandemi. hal>

Analisis ini juga menyoroti dampak hambatan (bottleneck effect) yang disebabkan oleh menurunnya angka infeksi Strep A selama pandemi COVID-19, seiring dengan meluasnya penerapan penjarakan sosial dan lockdown. Namun setelah periode ini, M1UK menyebar dengan cepat di Inggris, dengan peningkatan kasus demam berdarah dan infeksi Strep A yang invasif pada tahun 2022.

Menurut para peneliti, meskipun berkurangnya penularan Strep A selama pandemi mungkin menyebabkan melemahnya kekebalan pada populasi, penelitian mereka menyoroti fitur genetik M1UK yang menunjukkan keunggulan kelangsungan hidup dibandingkan strain lain, sehingga memungkinkan penyebarannya lebih mudah dan berpotensi menyebabkan penyakit yang lebih parah. Penyakit. Ada kemungkinan bahwa peningkatan kekebalan populasi terhadap strain M1UK memungkinkan munculnya jenis strain lain.

Profesor Sriskandan, yang juga direktur klinis Pusat Biologi Resistensi Bakteri, menambahkan: “Meskipun kita sekarang tahu bahwa varian M1UK bertanggung jawab atas peningkatan kasus yang signifikan pada musim dingin lalu, hal ini terjadi pada waktu yang tidak biasa dalam setahun, bertepatan dengan virus pernapasan dan stres musim dingin. Yang semuanya berkontribusi pada tingkat keparahannya. Pada akhirnya, lonjakan yang kita lihat di berbagai waktu di seluruh dunia kemungkinan besar disebabkan oleh penurunan kekebalan terhadap patogen pernapasan tertentu, terutama Strep A. Vaksin dapat membantu mencegah hal ini, dan kita sangat membutuhkan vaksin untuk melawan Strep A. Temuan terbaru ini adalah hasil penelitian kami. Hal ini dimungkinkan melalui kolaborasi erat antara peneliti penyakit menular di Imperial College dan sistem pengawasan molekuler terkemuka di dunia dari Badan Kesehatan Masyarakat Inggris."