Penentuan antibodi terhadap fraksi mikrosomal kelenjar tiroid digunakan untuk mendiagnosis tiroiditis autoimun dan hipotiroidisme, di mana kadar antibodi dalam darah meningkat. Antibodi terhadap mikrosom tiroid membentuk kompleks imun pada permukaan sel, mengaktifkan komplemen dan limfosit sitotoksik, yang menyebabkan kerusakan sel dan pembentukan proses inflamasi pada kelenjar tiroid.