Pada tuberkulosis primer, lesi biasanya terlokalisasi di kelenjar getah bening, paru-paru, pleura, dan terkadang di organ lain: ginjal, sendi, tulang, peritoneum. Area peradangan spesifik bisa sangat kecil dan tetap tersembunyi selama pemeriksaan. Jika lesi besar, biasanya terdeteksi selama pemeriksaan klinis dan radiologis pasien.