Komplikasi saluran empedu setelah transplantasi hati terjadi pada 10-20% kasus. Komplikasi ini meliputi penyempitan, kebocoran empedu, fistula, dan kolangitis. Penyempitan anastomosis yang disebabkan oleh kesalahan teknis, peradangan akibat kebocoran empedu dan fibrosis, dan penyempitan yang tidak terkait dengan anastomosis, yang terbentuk di atas anastomosis ke arah porta hepatis, yang dalam beberapa kasus disebabkan oleh iskemia duktus, dapat diamati.