Fistula empedu eksternal biasanya terbentuk setelah intervensi pada saluran empedu, seperti kolesistotomi, drainase transhepatik saluran empedu dan drainase saluran empedu umum melalui tabung T. Sangat jarang, fistula bisa terbentuk sebagai komplikasi cholelithiasis, kanker kandung empedu, atau trauma pada saluran empedu.